Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL2P13500 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL2P13500 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL2P13500 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms