Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL1A2P08123 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms