Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFLP07196 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFLP07196 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFLP07196 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFLP07196 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFLP07196 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms