Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms