Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNIKQ9UKE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms