Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD3Q9UJU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms