Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms