Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CARD17Q5XLA6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CARD17Q5XLA6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CARD17Q5XLA6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CARD17Q5XLA6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CARD17Q5XLA6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms