Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms