Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 STE14YDR410C 720 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 NTF2YER009W 378 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 GLC7YER133W 939 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SOD1YJR104C 465 nt3.22□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAR070CYAR070C 300 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 TVP18YMR071C 504 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PBI2YNL015W 228 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YNL150WYNL150W 408 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 GIS2YNL255C 462 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 snR41snR41 95 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SQS1YNL224C 2304 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 FLO9YAL063C 3969 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SKN7YHR206W 1869 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SEC15YGL233W 2733 nt3.21□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 GAL80YML051W 1308 nt3.21□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SKO1YNL167C 1944 nt3.21□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPT2YER161C 1002 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 HUR1YGL168W 333 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YKL069WYKL069W 543 nt3.21□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPH2YKL119C 648 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RPS21AYKR057W 264 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 HRI1YLR301W 735 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 PEX11YOL147C 711 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YBR012CYBR012C 420 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 TIM12YBR091C 330 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CMD1YBR109C 444 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 AUS1YOR011W 4185 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YOR296WYOR296W 3870 nt3.21□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CIN8YEL061C 3003 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YEL075CYEL075C 369 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CSE4YKL049C 690 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 VPS63YLR261C 327 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YLR416CYLR416C 399 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RPL6BYLR448W 531 nt3.2□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 GPI15YNL038W 690 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 SHG1YBR258C 429 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 NTO1YPR031W 2247 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 HRD1YOL013C 1656 nt3.2□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CHA4YLR098C 1947 nt3.19□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD5YLR032W 3510 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YCR064CYCR064C 411 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 SLD5YDR489W 885 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 GET1YGL020C 708 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YJR011CYJR011C 786 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 ACF4YJR083C 930 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 SDO1YLR022C 753 nt3.19□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAR047CYAR047C 321 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YBL071CYBL071C 309 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 VAM10YOR068C 345 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 HHF1YBR009C 312 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CDC40YDR364C 1368 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YMR018WYMR018W 1545 nt3.19□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 SET1YHR119W 3243 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 UBP5YER144C 2418 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YDR115WYDR115W 318 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YDR269CYDR269C 324 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 GRX2YDR513W 432 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YER079WYER079W 633 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YGR039WYGR039W 312 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YGR107WYGR107W 450 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RPI1YIL119C 1224 nt3.18□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YIR020CYIR020C 303 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RPA12YJR063W 378 nt3.18□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 INO4YOL108C 456 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 GRE2YOL151W 1029 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 CAT5YOR125C 702 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YPL107WYPL107W 747 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 MIT1YEL007W 2001 nt3.18□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 MDM36YPR083W 1740 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 IRC3YDR332W 2070 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 PRP22YER013W 3438 nt3.18□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 BEM4YPL161C 1902 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YEL025CYEL025C 3567 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YLR352WYLR352W 2424 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RSM24YDR175C 960 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 LIF1YGL090W 1266 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 ECL1YGR146C 636 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YHR138CYHR138C 345 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YLR012CYLR012C 300 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YKE2YLR200W 345 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YML003WYML003W 873 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YOR248WYOR248W 303 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 SVS1YPL163C 783 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 TPK2YPL203W 1143 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 snR35snR35 204 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 FLO5YHR211W 3228 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RPN3YER021W 1572 nt3.17□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 VIP1YLR410W 3441 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 RRP5YMR229C 5190 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 ARF1YDL192W 546 nt3.16□□□□□ -1.9
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