Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 ATP25YMR098C 1839 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 TIF4631YGR162W 2859 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ARO1YDR127W 4767 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 UTP15YMR093W 1542 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 MRP49YKL167C 414 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ECM4YKR076W 1113 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RNH203YLR154C 333 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YLR416CYLR416C 399 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RPL13BYMR142C 600 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YBR062CYBR062C 543 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RRI2YOL117W 1938 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 TRS120YDR407C 3870 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 STT4YLR305C 5703 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 AUS1YOR011W 4185 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YDL176WYDL176W 2127 nt3.61□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 PEX5YDR244W 1839 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPR022CYPR022C 3402 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YLR352WYLR352W 2424 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YNL193WYNL193W 1677 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SNA4YDL123W 423 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 AIM11YER093C-A 414 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SMX2YFL017W-A 234 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 DAD2YKR083C 402 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SFM1YOR021C 642 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 EAP1YKL204W 1899 nt3.6□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 DSF2YBR007C 2211 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RAD4YER162C 2265 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YCR064CYCR064C 411 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YGR073CYGR073C 372 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 MRP8YKL142W 660 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPR053CYPR053C 456 nt3.59□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 GCN1YGL195W 8019 nt3.59□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RUD3YOR216C 1455 nt3.59□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 IES6YEL044W 501 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YFL065CYFL065C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YGL015CYGL015C 393 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RPL1BYGL135W 654 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 HRI1YLR301W 735 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PEX11YOL147C 711 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YOR277CYOR277C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RPL1AYPL220W 654 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 AIM4YBR194W 372 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 MUD2YKL074C 1584 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 ETP1YHL010C 1758 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SKN7YHR206W 1869 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YBR259WYBR259W 2067 nt3.58□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 OPI6YDL096C 327 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YDR061WYDR061W 1620 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 CDC40YDR364C 1368 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RTR1YER139C 681 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 UBP5YER144C 2418 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 CDC26YFR036W 375 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 BCD1YHR040W 1101 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SSF1YHR066W 1362 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RSF2YJR127C 4143 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YKR078WYKR078W 1758 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 CDC123YLR215C 1083 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PDR17YNL264C 1053 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 HBT1YDL223C 3141 nt3.57□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YRR1YOR162C 2433 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SLA1YBL007C 3735 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PCK1YKR097W 1650 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 AHC2YCR082W 387 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PSF1YDR013W 627 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 EMI1YDR512C 564 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 VEL1YGL258W 621 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 MCR1YKL150W 909 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 AIM29YKR074W 468 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 DDR48YMR173W 1293 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RED1YLR263W 2484 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SYT1YPR095C 3681 nt3.56□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YDR338CYDR338C 2088 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SSL1YLR005W 1386 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 BI4Q0120 1917 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 VFA1YER128W 612 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RTS3YGR161C 792 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 VPH2YKL119C 648 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 COX8YLR395C 237 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 RAD33YML011C 534 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YPL142CYPL142C 318 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PIS1YPR113W 663 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YBR209WYBR209W 318 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 snR54snR54 86 nt3.55□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 PPN1YDR452W 2025 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 CIN1YOR349W 3045 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 SSM4YIL030C 3960 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 AIP1YMR092C 1848 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YDL009CYDL009C 324 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YER079WYER079W 633 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 BIG1YHR101C 1008 nt3.54□□□□□ -1.84
VHS3Q08438 YLR101CYLR101C 396 nt3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.8 ms