Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms