Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 snR191snR191 274 nt2.83□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SEC66YBR171W 621 nt2.83□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 MBA1YBR185C 837 nt2.83□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 JSN1YJR091C 3276 nt2.83□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SSN2YDR443C 4263 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 MRH1YDR033W 963 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YDR209CYDR209C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YLR297WYLR297W 390 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YPR014CYPR014C 330 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 RXT2YBR095C 1293 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 STE6YKL209C 3873 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 FAA2YER015W 2235 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 ESC2YDR363W 1371 nt2.82□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 PCL5YHR071W 690 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 IPP1YBR011C 864 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 HEM4YOR278W 828 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 CUR1YPR158W 759 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SLF1YDR515W 1344 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 NMA111YNL123W 2994 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YEL1YBL060W 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 STI1YOR027W 1770 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 RAD18YCR066W 1464 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 GIM5YML094W 492 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YGR067CYGR067C 2415 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 POM152YMR129W 4014 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YIL080WYIL080W 4722 nt2.8□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 APC2YLR127C 2562 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 STE2YFL026W 1296 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 MST28YAR033W 705 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SMD2YLR275W 333 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 TRM2YKR056W 1920 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 LST4YKL176C 2487 nt2.79□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 ECM21YBL101C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 ADY4YLR227C 1482 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SWR1YDR334W 4545 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YLR446WYLR446W 1302 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 UBC13YDR092W 462 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 RRT13YER066W 558 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 MIC19YFR011C 513 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YMR31YFR049W 372 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YHR213WYHR213W 597 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 SYS1YJL004C 612 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YAL037WYAL037W 804 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 YAR062WYAR062W 597 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 ECI1YLR284C 843 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 CWC24YLR323C 780 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 MRPL33YMR286W 261 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 NIP7YPL211W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
CIK1Q01649 ESC1YMR219W 4977 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 AST2YER101C 1293 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NOP19YGR251W 591 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SEC28YIL076W 891 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YJR020WYJR020W 333 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 TDA8YAL064C-A 381 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YOR385WYOR385W 873 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 ANR2YKL047W 1551 nt2.77□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NPR3YHL023C 3441 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 NMD2YHR077C 3270 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 THG1YGR024C 714 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RPL17BYJL177W 555 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 MRP49YKL167C 414 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YPT6YLR262C 648 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RRT16YNL105W 429 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 COQ10YOL008W 624 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YDR338CYDR338C 2088 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 MDM1YML104C 3384 nt2.76□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 GCV2YMR189W 3105 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 VPS38YLR360W 1320 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YJL132WYJL132W 2253 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 CDC37YDR168W 1521 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YCR090CYCR090C 549 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SUI2YJR007W 915 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YLL044WYLL044W 447 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YLR217WYLR217W 324 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RPL6AYML073C 531 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YRO2YBR054W 1035 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 SSP1YHR184W 1716 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YLR001CYLR001C 2589 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 BNR1YIL159W 4128 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 GCD10YNL062C 1437 nt2.75□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YBT1YLL048C 4986 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 TMA64YDR117C 1698 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YLR108CYLR108C 1458 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 DTD1YDL219W 453 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 YHL005CYHL005C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 RPS22AYJL190C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
CIK1Q01649 IRC21YMR073C 606 nt2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.6 ms