Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 MPS1YDL028C 2295 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SPT16YGL207W 3108 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RED1YLR263W 2484 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YDL050CYDL050C 372 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RSM24YDR175C 960 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 AIM11YER093C-A 414 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PHO81YGR233C 3537 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 VPS51YKR020W 495 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ARC18YLR370C 537 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ATX2YOR079C 942 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YPL142CYPL142C 318 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 FRE8YLR047C 2061 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 SCY1YGL083W 2415 nt3.4□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RTT105YER104W 627 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YLR252WYLR252W 306 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PDS5YMR076C 3834 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YBR062CYBR062C 543 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 TMA108YIL137C 2841 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ADY4YLR227C 1482 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YGR237CYGR237C 2358 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 UTP15YMR093W 1542 nt3.39□□□□□ -1.87
VFA1P40080 MDM1YML104C 3384 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 USE1YGL098W 738 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YGR042WYGR042W 816 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YIR020CYIR020C 303 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 LSM1YJL124C 519 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PDP3YLR455W 915 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YNL193WYNL193W 1677 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 EAP1YKL204W 1899 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ASM4YDL088C 1587 nt3.38□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RAD4YER162C 2265 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 KAR9YPL269W 1935 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 SNU56YDR240C 1479 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 SYM1YLR251W 594 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ADI1YMR009W 540 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YNL324WYNL324W 396 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RSM19YNR037C 276 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 MRPL40YPL173W 894 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 NTC20YBR188C 423 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 MUS81YDR386W 1899 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 CBP2YHL038C 1893 nt3.37□□□□□ -1.87
VFA1P40080 MSH4YFL003C 2637 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YDR537CYDR537C 606 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 ECO1YFR027W 846 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RPL9AYGL147C 576 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RPL16AYIL133C 600 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RIM9YMR063W 720 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PEX11YOL147C 711 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 DSF2YBR007C 2211 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 NMD2YHR077C 3270 nt3.36□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YHR080CYHR080C 4038 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 MAK5YBR142W 2322 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 IRC2YDR112W 309 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 RPC37YKR025W 849 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 SFM1YOR021C 642 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YOR331CYOR331C 558 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PCK1YKR097W 1650 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 UBP5YER144C 2418 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 FAS1YKL182W 6156 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YDR338CYDR338C 2088 nt3.35□□□□□ -1.87
VFA1P40080 CHS3YBR023C 3498 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 DAL5YJR152W 1632 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 NTO1YPR031W 2247 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 snR56snR56 88 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 CWC24YLR323C 780 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 COX8YLR395C 237 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 HHF2YNL030W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 PIS1YPR113W 663 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.34□□□□□ -1.87
VFA1P40080 YJR030CYJR030C 2238 nt3.34□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SYT1YPR095C 3681 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YGR053CYGR053C 852 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 COX2Q0250 756 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 COX23YHR116W 456 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 AFB1YLR040C 675 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 snR17asnR17a 333 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 CWH41YGL027C 2502 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 HFM1YGL251C 3564 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 HOP1YIL072W 1818 nt3.33□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YRR1YOR162C 2433 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 ENV10YLR065C 546 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YPL088WYPL088W 1029 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YPR096CYPR096C 303 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 TMA64YDR117C 1698 nt3.32□□□□□ -1.88
VFA1P40080 UBP16YPL072W 1500 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 MAL33YBR297W 1407 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 RPB9YGL070C 369 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 COX13YGL191W 390 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 PDX1YGR193C 1233 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YHR130CYHR130C 336 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YJL169WYJL169W 369 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YKL044WYKL044W 321 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SVS1YPL163C 783 nt3.31□□□□□ -1.88
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