Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 YJL007CYJL007C 315 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL20AP0CX23 SOD1YJR104C 465 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL20AP0CX23 CSE4YKL049C 690 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL20AP0CX23 TPK2YPL203W 1143 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL20AP0CX23 UBP5YER144C 2418 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL20AP0CX23 GAL80YML051W 1308 nt2.84□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SEC15YGL233W 2733 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YDR199WYDR199W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YFR054CYFR054C 579 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YGR039WYGR039W 312 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SDP1YIL113W 630 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 DYN3YMR299C 939 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 CSI2YOL007C 1026 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YBR051WYBR051W 351 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 MUB1YMR100W 1863 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SKO1YNL167C 1944 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SIZ1YDR409W 2715 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 STE23YLR389C 3084 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 STI1YOR027W 1770 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 snR56snR56 88 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 snR59snR59 78 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 MET32YDR253C 576 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 MIC19YFR011C 513 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YGR073CYGR073C 372 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 APC9YLR102C 798 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RNH203YLR154C 333 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RPS28BYLR264W 204 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 BER1YLR412W 825 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RPS16AYMR143W 432 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PHO80YOL001W 882 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YOR277CYOR277C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 AVT5YBL089W 1380 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SNU56YDR240C 1479 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SPR3YGR059W 1539 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SHS1YDL225W 1656 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 EMP70YLR083C 2004 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 CHO2YGR157W 2610 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SNA4YDL123W 423 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SMT3YDR510W 306 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YGR042WYGR042W 816 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YGR107WYGR107W 450 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR224WYLR224W 1110 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 ATX2YOR079C 942 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 TIM12YBR091C 330 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SWC4YGR002C 1431 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RNT1YMR239C 1416 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PEX5YDR244W 1839 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 STT4YLR305C 5703 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 FLO9YAL063C 3969 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 FLO5YHR211W 3228 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 REG1YDR028C 3045 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 EPL1YFL024C 2499 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RIM13YMR154C 2184 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 TCP1YDR212W 1680 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YMR018WYMR018W 1545 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 VMA8YEL051W 771 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 CHZ1YER030W 462 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RSR1YGR152C 819 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 HHF2YNL030W 312 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YPR053CYPR053C 456 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 BMS1YPL217C 3552 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 CIN1YOR349W 3045 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 ROM1YGR070W 3468 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 XRN1YGL173C 4587 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 ADY4YLR227C 1482 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SHE4YOR035C 2370 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YJL132WYJL132W 2253 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YDL050CYDL050C 372 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YFL065CYFL065C 309 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YIR020CYIR020C 303 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR012CYLR012C 300 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YLR076CYLR076C 423 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PDP3YLR455W 915 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YMR141CYMR141C 309 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PDR17YNL264C 1053 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SSE2YBR169C 2082 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 FAA2YER015W 2235 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 ASM4YDL088C 1587 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 MDV1YJL112W 2145 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 MAK21YDR060W 3078 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PPH3YDR075W 927 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 PET54YGR222W 882 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 VPS51YKR020W 495 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 RPC37YKR025W 849 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL20AP0CX23 SYM1YLR251W 594 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.8 ms