Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL1A2P08123 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL1A2P08123 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms