Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD3Q9NX63 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms