Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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