Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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