Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTP4A2Q12974 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTP4A2Q12974 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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