Protein–RNA interactions for Protein: P53962

YNL035C, Uncharacterized WD repeat-containing protein YNL035C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL035CP53962 YHL005CYHL005C 393 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 BUD14YAR014C 2130 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PPG1YNR032W 1107 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PIN3YPR154W 648 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 RLM1YPL089C 2031 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 ARG4YHR018C 1392 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 OPI6YDL096C 327 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PAN6YIL145C 930 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PWP1YLR196W 1731 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YNL276CYNL276C 396 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 TRM7YBR061C 933 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 TEA1YOR337W 2280 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YOR365CYOR365C 2112 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 TRM2YKR056W 1920 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PEX8YGR077C 1770 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 MAG2YLR427W 2013 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YVC1YOR087W 2028 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 VPS27YNR006W 1869 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 TRP5YGL026C 2124 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 COG8YML071C 1824 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 ATP25YMR098C 1839 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YSW1YBR148W 1830 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 RPL35AYDL191W 363 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YFL015CYFL015C 495 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 RPL29YFR032C-A 180 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 PRE8YML092C 753 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 VNX1YNL321W 2727 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 AGA1YNR044W 2178 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 TKL1YPR074C 2043 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 PHO84YML123C 1764 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 ELP2YGR200C 2367 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YHR182WYHR182W 2358 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YIL024CYIL024C 570 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SRP101YDR292C 1866 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 DAL81YIR023W 2913 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 ARG2YJL071W 1725 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 DBF20YPR111W 1695 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SED4YCR067C 3198 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YDL228CYDL228C 642 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YAR068WYAR068W 486 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 LSM7YNL147W 348 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 PHO2YDL106C 1680 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 CYK3YDL117W 2658 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 BIT61YJL058C 1632 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 CLA4YNL298W 2529 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 RPS11AYDR025W 471 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SNU13YEL026W 381 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 VEL1YGL258W 621 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 PET191YJR034W 327 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YLR076CYLR076C 423 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 SIP18YMR175W 240 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 DBP6YNR038W 1890 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 ACC1YNR016C 6702 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 CEP3YMR168C 1827 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 MDM30YLR368W 1797 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YLR053CYLR053C 327 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 HHF2YNL030W 312 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 REI1YBR267W 1182 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 MGR1YCL044C 1254 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 TRF5YNL299W 1929 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 HOYDL227C 1761 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 MCX1YBR227C 1563 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 MNT4YNR059W 1743 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YDR355CYDR355C 303 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 YHL026CYHL026C 948 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 RPS4BYHR203C 786 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 ACS2YLR153C 2052 nt5.71□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 UTP13YLR222C 2454 nt5.71□□□□□ -1.49
YNL035CP53962 RTS1YOR014W 2274 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 RPS13YDR064W 456 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 EMP24YGL200C 612 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YHR210CYHR210C 1026 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 SLK19YOR195W 2466 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YHL042WYHL042W 453 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YOR050CYOR050C 348 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 HSP82YPL240C 2130 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 SWD3YBR175W 948 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 VID30YGL227W 2877 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 SYG1YIL047C 2709 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 EMW1YNL313C 2715 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 RPS27BYHR021C 249 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 YIL102CYIL102C 306 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 PRP42YDR235W 1635 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 MSS4YDR208W 2340 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 SMI1YGR229C 1518 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 EXO70YJL085W 1872 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 NOP53YPL146C 1368 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL035CP53962 ATP17YDR377W 306 nt5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.5 ms