Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOP58Q9Y2X3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP58Q9Y2X3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms