Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms