Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOHLH1Q5JUK2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SOHLH1Q5JUK2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SOHLH1Q5JUK2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOHLH1Q5JUK2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms