Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms