Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms