Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms