Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 RED1YLR263W 2484 nt3.82□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 OSH3YHR073W 2991 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 ERT1YBR239C 1590 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YME2YMR302C 2553 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 VMA10YHR039C-A 345 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 LIN1YHR156C 1023 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 CAP1YKL007W 807 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 LCL2YLR104W 396 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 PDR17YNL264C 1053 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YOR331CYOR331C 558 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 TPK2YPL203W 1143 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 snR35snR35 204 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 MPS1YDL028C 2295 nt3.81□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 VPS3YDR495C 3036 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 STD1YOR047C 1335 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 MDN1YLR106C 14733 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YDR042CYDR042C 603 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 HMF1YER057C 390 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 LOC1YFR001W 615 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 DAL2YIR029W 1032 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 TPK3YKL166C 1197 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YNL303WYNL303W 348 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 ARL3YPL051W 597 nt3.8□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 MUB1YMR100W 1863 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YGL140CYGL140C 3660 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 FRE8YLR047C 2061 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 SRD1YCR018C 666 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 PEX10YDR265W 1014 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 CPR5YDR304C 678 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 PGD1YGL025C 1194 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YKL069WYKL069W 543 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 RCN1YKL159C 636 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 RPN13YLR421C 471 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 SHG1YBR258C 429 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 FAA2YER015W 2235 nt3.79□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 SPT6YGR116W 4356 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YCL020WYCL020W 1317 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 GYL1YMR192W 2163 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 MUS81YDR386W 1899 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 DBP3YGL078C 1572 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YCR013CYCR013C 648 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YDL050CYDL050C 372 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 RSM28YDR494W 1086 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 SOP4YJL192C 705 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YKR011CYKR011C 1062 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 PFY1YOR122C 381 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YOR152CYOR152C 771 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YCL002CYCL002C 792 nt3.78□□□□□ -1.8
NYV1Q12255 YDR061WYDR061W 1620 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 ESC2YDR363W 1371 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 DAN4YJR151C 3486 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 SEC15YGL233W 2733 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 HMO1YDR174W 741 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 EMI1YDR512C 564 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 RTT105YER104W 627 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 VEL1YGL258W 621 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 Q0144Q0144 330 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 AIM18YHR198C 966 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YIL141WYIL141W 390 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 CCW14YLR390W-A 717 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 VAC14YLR386W 2643 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YPR003CYPR003C 2265 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 MSH2YOL090W 2895 nt3.77□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 ECM21YBL101C 3354 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 TIF4631YGR162W 2859 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 SSE2YBR169C 2082 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 SDP1YIL113W 630 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YKL070WYKL070W 510 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 SRL4YPL033C 846 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 URB2YJR041C 3525 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 RPA190YOR341W 4995 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YKL222CYKL222C 2118 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 STU2YLR045C 2667 nt3.76□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 KRE2YDR483W 1329 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 BCH1YMR237W 2175 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YDL242WYDL242W 354 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YFR054CYFR054C 579 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 RPB9YGL070C 369 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 AIM25YJR100C 984 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 MPD2YOL088C 834 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 RPS7AYOR096W 573 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YPL142CYPL142C 318 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YCL007CYCL007C 393 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 BRE5YNR051C 1548 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 ENA2YDR039C 3276 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 ENA1YDR040C 3276 nt3.75□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 MNL1YHR204W 2391 nt3.74□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.74□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 MRP8YKL142W 660 nt3.74□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 ATP11YNL315C 957 nt3.74□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 SLK19YOR195W 2466 nt3.74□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 NUR1YDL089W 1455 nt3.73□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 MNT3YIL014W 1893 nt3.73□□□□□ -1.81
NYV1Q12255 CHO2YGR157W 2610 nt3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.4 ms