Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 AVT5YBL089W 1380 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 JJJ1YNL227C 1773 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RRM3YHR031C 2172 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MNT3YIL014W 1893 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YBP2YGL060W 1926 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YGL176CYGL176C 1665 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RTT105YER104W 627 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MAM1YER106W 909 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPB9YGL070C 369 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SEC28YIL076W 891 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 COA4YLR218C 453 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 INO4YOL108C 456 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SFG1YOR315W 1041 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 KAR4YCL055W 1008 nt3.09□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 HBT1YDL223C 3141 nt3.09□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 RCY1YJL204C 2523 nt3.09□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 ROG1YGL144C 2058 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PDS5YMR076C 3834 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 MSB2YGR014W 3921 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PEX5YDR244W 1839 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 CTK2YJL006C 972 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YLR366WYLR366W 306 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 FAR3YMR052W 615 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PDR17YNL264C 1053 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 ECM21YBL101C 3354 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PSK1YAL017W 4071 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YJL049WYJL049W 1353 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 TSC11YER093C 4293 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 JIP5YPR169W 1479 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 EXO84YBR102C 2262 nt3.08□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 FRE8YLR047C 2061 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 BMH2YDR099W 822 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 ATC1YDR184C 885 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PPX1YHR201C 1194 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YHR212CYHR212C 336 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YAR060CYAR060C 336 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 BUD21YOR078W 645 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 IPP1YBR011C 864 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 BTS1YPL069C 1008 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 AEP1YMR064W 1557 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 CIK1YMR198W 1785 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SAG1YJR004C 1953 nt3.07□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 BNI4YNL233W 2679 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 ATP16YDL004W 483 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 FMN1YDR236C 657 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 UTP5YDR398W 1932 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 RPL23BYER117W 414 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 EFG1YGR271C-A 702 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 DAL2YIR029W 1032 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YLR076CYLR076C 423 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YMR046CYMR046C 1323 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 GCY1YOR120W 939 nt3.06□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 Q0255Q0255 1419 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 MIX14YDR031W 366 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 DYN2YDR424C 279 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YDR442WYDR442W 393 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 VAB2YEL005C 849 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YFL015CYFL015C 495 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YGL039WYGL039W 1047 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 MRPL9YGR220C 810 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YHL005CYHL005C 393 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 DIM1YPL266W 957 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 RIX1YHR197W 2292 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 DBP10YDL031W 2988 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SYO1YDL063C 1863 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 MUB1YMR100W 1863 nt3.05□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 NOP56YLR197W 1515 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SNQ2YDR011W 4506 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 CBS2YDR197W 1170 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 GPX1YKL026C 504 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YKL070WYKL070W 510 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SDH3YKL141W 597 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SUB1YMR039C 879 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YPR027CYPR027C 834 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 snR35snR35 204 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 PDC2YDR081C 2778 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 KAP104YBR017C 2757 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SRP1YNL189W 1629 nt3.04□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 TAO3YIL129C 7131 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 ARP5YNL059C 2268 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 VAC14YLR386W 2643 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 VMA8YEL051W 771 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 GOS1YHL031C 672 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YLR050CYLR050C 486 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YLR297WYLR297W 390 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 SMA2YML066C 1110 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 MER1YNL210W 813 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YBR090CYBR090C 369 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YDR061WYDR061W 1620 nt3.03□□□□□ -1.92
VPS54Q12071 YIL169CYIL169C 2988 nt3.03□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 DIA2YOR080W 2199 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 ILS1YBL076C 3219 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 URB2YJR041C 3525 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 PUF6YDR496C 1971 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SKP2YNL311C 2292 nt3.02□□□□□ -1.93
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