Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms