Protein–RNA interactions for Protein: P46969

RPE1, Ribulose-phosphate 3-epimerase, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPE1P46969 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.46□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SMC2YFR031C 3513 nt2.46□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SPP382YLR424W 2127 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 VPS3YDR495C 3036 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDL050CYDL050C 372 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 PSF2YJL072C 642 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 ENV10YLR065C 546 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YLR400WYLR400W 474 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MRPS8YMR158W 468 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YPR027CYPR027C 834 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 snR44snR44 211 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 DSE1YER124C 1722 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MYO5YMR109W 3660 nt2.45□□□□□ -2.02
RPE1P46969 HBT1YDL223C 3141 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YHR078WYHR078W 1659 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SGM1YJR134C 2124 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 TPO5YKL174C 1857 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 ERP3YDL018C 678 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 FIN1YDR130C 876 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MFA1YDR461W 111 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RGI1YER067W 486 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RPB9YGL070C 369 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RPL24BYGR148C 468 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YNL109WYNL109W 546 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 LTP1YPR073C 486 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 DPB3YBR278W 606 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SEC26YDR238C 2922 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 BI3Q0115 1554 nt2.44□□□□□ -2.02
RPE1P46969 KAR1YNL188W 1302 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 GCD2YGR083C 1956 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YPL150WYPL150W 2706 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MSH2YOL090W 2895 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RTT105YER104W 627 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 EFG1YGR271C-A 702 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGR293CYGR293C 462 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YKL131WYKL131W 522 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 JIP3YLR331C 378 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 TYE7YOR344C 876 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 ART10YLR392C 1557 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YKR078WYKR078W 1758 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 GIN4YDR507C 3429 nt2.43□□□□□ -2.02
RPE1P46969 PSP1YDR505C 2526 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 DNA2YHR164C 4569 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 PEX6YNL329C 3093 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 NMA111YNL123W 2994 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 NUM1YDR150W 8247 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 UBC9YDL064W 474 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 AI3Q0060 1248 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGL117WYGL117W 798 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YJR020WYJR020W 333 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 NNF1YJR112W 606 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 CCE1YKL011C 1062 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SED5YLR026C 1023 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MRPL17YNL252C 846 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YNL276CYNL276C 396 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YOL114CYOL114C 609 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 ACM1YPL267W 630 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 VAC14YLR386W 2643 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SRP68YPL243W 1800 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 BNR1YIL159W 4128 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 BNI4YNL233W 2679 nt2.42□□□□□ -2.02
RPE1P46969 IRC3YDR332W 2070 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MUS81YDR386W 1899 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 NAB3YPL190C 2409 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YCG1YDR325W 3108 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MRPL32YCR003W 552 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 snR70snR70 164 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGR111WYGR111W 1203 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RPL17BYJL177W 555 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RPA12YJR063W 378 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 DIA1YMR316W 1011 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YOR387CYOR387C 621 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 RPO41YFL036W 4056 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 MNT3YIL014W 1893 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 UBP8YMR223W 1416 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 CIK1YMR198W 1785 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 SLP1YOR154W 1764 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.41□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YER138CYER138C 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YER160CYER160C 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
RPE1P46969 YJR027WYJR027W 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.8 ms