Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHKA1P46020 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms