Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2E1P29083 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms