Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD2Q9BYW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD2Q9BYW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD2Q9BYW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD2Q9BYW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD2Q9BYW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD2Q9BYW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms