Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LYSTQ99698 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LYSTQ99698 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYSTQ99698 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYSTQ99698 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LYSTQ99698 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms