Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.542e-7■■■■■ 50.4
DHX30Q7L2E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.392e-7■■■■■ 50.4
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 418.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 50.3
DHX30Q7L2E3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.841e-6■■■■■ 50.3
DHX30Q7L2E3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.943e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 332.56■■■□□ 2.83e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.783e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 232.1■■■□□ 2.733e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.563e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 430.52■■■□□ 2.483e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 530.52■■■□□ 2.483e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.683e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 416.71■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 412.17□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 311.14□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 NADK2-208ENST00000511088 579 ntTSL 49.88□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 56.29□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 50.2
DHX30Q7L2E3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 325.43■■□□□ 1.664e-7■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 519.94■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 AC004801.4-201ENST00000546738 3112 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 50.1
DHX30Q7L2E3 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 518.45■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 49.9
DHX30Q7L2E3 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 49.9
DHX30Q7L2E3 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 213.67□□□□□ -0.226e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.396e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.686e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.86e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 37.53□□□□□ -1.26e-12■■■■■ 49.8
DHX30Q7L2E3 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 49.7
DHX30Q7L2E3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 49.4
DHX30Q7L2E3 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 227.32■■□□□ 1.965e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)21.75■■□□□ 1.075e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 321.17■□□□□ 0.985e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.646e-13■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 519.02■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-206ENST00000468951 661 ntTSL 318.97■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-204ENST00000460956 637 ntTSL 518.64■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 313.04□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 49
DHX30Q7L2E3 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.52■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 48.7
DHX30Q7L2E3 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.98■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 48.7
DHX30Q7L2E3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 48.7
DHX30Q7L2E3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 48.7
DHX30Q7L2E3 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 48.7
DHX30Q7L2E3 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 218.14■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 47.8
DHX30Q7L2E3 MTCO1P2-201ENST00000554243 703 ntBASIC9.78□□□□□ -0.847e-37■■■■■ 47.8
DHX30Q7L2E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.519e-7■■■■■ 47.7
DHX30Q7L2E3 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 518.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 47.7
DHX30Q7L2E3 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 47.7
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 518.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 46.8
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 415.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 46.8
DHX30Q7L2E3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 MELTF-203ENST00000439320 629 ntTSL 320.77■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 46.5
DHX30Q7L2E3 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 335.71■■■■□ 3.311e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 MMP17-210ENST00000545671 775 ntTSL 328.92■■■□□ 2.221e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 MMP17-211ENST00000545790 552 ntTSL 227.25■■□□□ 1.951e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-209ENST00000588857 1555 ntTSL 1 (best)25.1■■□□□ 1.611e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-212ENST00000590096 1282 ntTSL 524.75■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-208ENST00000588667 1619 ntTSL 1 (best)23.38■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-204ENST00000586417 1752 ntTSL 222.88■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 ATG4D-203ENST00000585752 729 ntTSL 521.95■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 316.04■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-20■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-20■■■■■ 46
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 180.6 ms