RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545790.5

MMP17-211, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

TSL 2

Gene MMP17, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-211ENST00000545790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.31■■■■■ 6.6
MMP17-211ENST00000545790 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50■■■■■ 5.6
MMP17-211ENST00000545790 ABCC9O60706 1549 aa48.65■■■■■ 5.38
MMP17-211ENST00000545790 NACADO15069 1562 aa46.99■■■■■ 5.11
MMP17-211ENST00000545790 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
MMP17-211ENST00000545790 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.97■■■■■ 5.11
MMP17-211ENST00000545790 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
MMP17-211ENST00000545790 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.82■■■■■ 5.09
MMP17-211ENST00000545790 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.66■■■■■ 5.06
MMP17-211ENST00000545790 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.78■■■■■ 4.92
MMP17-211ENST00000545790 SCRIBQ14160 1630 aa45.54■■■■■ 4.88
MMP17-211ENST00000545790 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
MMP17-211ENST00000545790 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.44■■■■■ 4.86
MMP17-211ENST00000545790 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.17■■■■■ 4.82
MMP17-211ENST00000545790 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.41■■■■■ 4.7
MMP17-211ENST00000545790 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
MMP17-211ENST00000545790 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.02■■■■■ 4.64
MMP17-211ENST00000545790 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
MMP17-211ENST00000545790 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MMP17-211ENST00000545790 SMARCA4P51532 1647 aa43.62■■■■■ 4.57
MMP17-211ENST00000545790 SMARCA2P51531 1590 aa43.37■■■■■ 4.53
MMP17-211ENST00000545790 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.36■■■■■ 4.53
MMP17-211ENST00000545790 NCAPD3P42695 1498 aa43.35■■■■■ 4.53
MMP17-211ENST00000545790 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.33■■■■■ 4.53
MMP17-211ENST00000545790 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.24■■■■■ 4.51
MMP17-211ENST00000545790 HMGXB3Q12766 1538 aa43.14■■■■■ 4.5
MMP17-211ENST00000545790 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
MMP17-211ENST00000545790 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
MMP17-211ENST00000545790 WIZO95785 1651 aa42.87■■■■■ 4.45
MMP17-211ENST00000545790 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
MMP17-211ENST00000545790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.18■■■■■ 4.34
MMP17-211ENST00000545790 NESP48681 1621 aa42.12■■■■■ 4.33
MMP17-211ENST00000545790 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.09■■■■■ 4.33
MMP17-211ENST00000545790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
MMP17-211ENST00000545790 ERCC6Q03468 1493 aa41.99■■■■■ 4.31
MMP17-211ENST00000545790 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.98■■■■■ 4.31
MMP17-211ENST00000545790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.92■■■■■ 4.3
MMP17-211ENST00000545790 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
MMP17-211ENST00000545790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.64■■■■■ 4.26
MMP17-211ENST00000545790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.58■■■■■ 4.25
MMP17-211ENST00000545790 PRDM2Q13029 1718 aa41.55■■■■■ 4.24
MMP17-211ENST00000545790 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
MMP17-211ENST00000545790 CUX2O14529 1486 aa41.51■■■■■ 4.24
MMP17-211ENST00000545790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
MMP17-211ENST00000545790 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.42■■■■■ 4.22
MMP17-211ENST00000545790 WDR62O43379 1518 aa41.25■■■■■ 4.19
MMP17-211ENST00000545790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
MMP17-211ENST00000545790 ABCC8Q09428 1581 aa41.06■■■■■ 4.16
MMP17-211ENST00000545790 TOPBP1Q92547 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
MMP17-211ENST00000545790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.91■■■■■ 4.14
MMP17-211ENST00000545790 IFT140Q96RY7 1462 aa40.67■■■■■ 4.1
MMP17-211ENST00000545790 CUX1P39880 1505 aa40.65■■■■■ 4.1
MMP17-211ENST00000545790 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
MMP17-211ENST00000545790 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.089e-6■■■■■ 50.1
MMP17-211ENST00000545790 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.51■■■■■ 4.08
MMP17-211ENST00000545790 SOGA1O94964 1423 aa40.47■■■■■ 4.07
MMP17-211ENST00000545790 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
MMP17-211ENST00000545790 TOP2BQ02880 1626 aa40.4■■■■■ 4.06
MMP17-211ENST00000545790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.38■■■■■ 4.06
MMP17-211ENST00000545790 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.36■■■■■ 4.05
MMP17-211ENST00000545790 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
MMP17-211ENST00000545790 SYNJ1O43426 1573 aa40.33■■■■■ 4.05
MMP17-211ENST00000545790 WDR97A6NE52 1622 aa40.25■■■■■ 4.03
MMP17-211ENST00000545790 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
MMP17-211ENST00000545790 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.024e-6■■□□□ 13.5
MMP17-211ENST00000545790 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.17■■■■■ 4.02
MMP17-211ENST00000545790 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
MMP17-211ENST00000545790 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
MMP17-211ENST00000545790 GRIN2BQ13224 1484 aa39.98■■■■□ 3.99
MMP17-211ENST00000545790 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.97■■■■□ 3.99
MMP17-211ENST00000545790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.94■■■■□ 3.99
MMP17-211ENST00000545790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
MMP17-211ENST00000545790 OSCARQ8IYS5 282 aa39.85■■■■□ 3.97
MMP17-211ENST00000545790 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
MMP17-211ENST00000545790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.83■■■■□ 3.97
MMP17-211ENST00000545790 TRIM41Q8WV44 630 aa39.75■■■■□ 3.95
MMP17-211ENST00000545790 FBLN2P98095 1184 aa39.72■■■■□ 3.95
MMP17-211ENST00000545790 KIF27Q86VH2 1401 aa39.72■■■■□ 3.95
MMP17-211ENST00000545790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.71■■■■□ 3.95
MMP17-211ENST00000545790 SYNJ2O15056 1496 aa39.69■■■■□ 3.94
MMP17-211ENST00000545790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
MMP17-211ENST00000545790 CHD1O14646 1710 aa39.67■■■■□ 3.94
MMP17-211ENST00000545790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
MMP17-211ENST00000545790 ADAMTS12P58397 1594 aa39.55■■■■□ 3.92
MMP17-211ENST00000545790 IGF1RP08069 1367 aa39.47■■■■□ 3.91
MMP17-211ENST00000545790 GRIN2AQ12879 1464 aa39.43■■■■□ 3.9
MMP17-211ENST00000545790 CUL7Q14999 1698 aa39.39■■■■□ 3.9
MMP17-211ENST00000545790 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.34■■■■□ 3.89
MMP17-211ENST00000545790 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.28■■■■□ 3.88
MMP17-211ENST00000545790 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.27■■■■□ 3.88
MMP17-211ENST00000545790 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.26■■■■□ 3.88
MMP17-211ENST00000545790 NUP160Q12769 1436 aa39.25■■■■□ 3.87
MMP17-211ENST00000545790 CEP170Q5SW79 1584 aa39.17■■■■□ 3.86
MMP17-211ENST00000545790 EEA1Q15075 1411 aa39.14■■■■□ 3.86
MMP17-211ENST00000545790 ARHGEF11O15085 1522 aa39.1■■■■□ 3.85
MMP17-211ENST00000545790 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
MMP17-211ENST00000545790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
MMP17-211ENST00000545790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
MMP17-211ENST00000545790 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.06■■■■□ 3.84
MMP17-211ENST00000545790 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.5 ms