Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 DNAJC7-209ENST00000587727 449 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-211ENST00000588814 1719 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-204ENST00000585693 562 ntTSL 210.58□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 27.71□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 37.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 PPP4R3A-210ENST00000555718 819 ntTSL 57.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 55.56□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 27.1
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PUM1Q14671 DNMT1-214ENST00000588118 973 ntTSL 512.63□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-206ENST00000586086 489 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-8■■■■□ 26.7
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PUM1Q14671 DNMT1-226ENST00000592054 591 ntTSL 44.35□□□□□ -1.714e-8■■■■□ 26.7
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PUM1Q14671 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.035e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 26.4
PUM1Q14671 TACO1-202ENST00000581120 2304 ntTSL 215.52■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 26.4
PUM1Q14671 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 26.2
PUM1Q14671 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 26.2
PUM1Q14671 CDC25A-203ENST00000437972 730 ntTSL 330.71■■■□□ 2.512e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 BOP1-206ENST00000569712 556 ntTSL 328.15■■■□□ 2.12e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AC074143.1-201ENST00000580114 1287 ntAPPRIS P5 TSL 525.62■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-203ENST00000461267 804 ntTSL 325.21■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 524.54■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 222.38■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 521.98■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-205ENST00000591196 2640 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 25.8
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