RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.38■■■■□ 3.09
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.82■■■□□ 2.36
CNOT8-201ENST00000285896 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CNOT8-201ENST00000285896 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.44■■■□□ 2.14
CNOT8-201ENST00000285896 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.39■■■□□ 2.14
CNOT8-201ENST00000285896 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.26■■■□□ 2.11
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC9O60706 1549 aa28.15■■■□□ 2.1
CNOT8-201ENST00000285896 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.99■■■□□ 2.07
CNOT8-201ENST00000285896 NACADO15069 1562 aa27.78■■■□□ 2.04
CNOT8-201ENST00000285896 SCRIBQ14160 1630 aa27.53■■■□□ 2
CNOT8-201ENST00000285896 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.5■■□□□ 1.99
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CNOT8-201ENST00000285896 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.91■■□□□ 1.9
CNOT8-201ENST00000285896 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CNOT8-201ENST00000285896 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.73■■□□□ 1.87
CNOT8-201ENST00000285896 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.68■■□□□ 1.86
CNOT8-201ENST00000285896 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
CNOT8-201ENST00000285896 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.58■■□□□ 1.85
CNOT8-201ENST00000285896 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CNOT8-201ENST00000285896 SMARCA4P51532 1647 aa26.37■■□□□ 1.81
CNOT8-201ENST00000285896 WIZO95785 1651 aa26.36■■□□□ 1.81
CNOT8-201ENST00000285896 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.18■■□□□ 1.78
CNOT8-201ENST00000285896 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CNOT8-201ENST00000285896 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.03■■□□□ 1.76
CNOT8-201ENST00000285896 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
CNOT8-201ENST00000285896 SMARCA2P51531 1590 aa25.9■■□□□ 1.74
CNOT8-201ENST00000285896 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.85■■□□□ 1.73
CNOT8-201ENST00000285896 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CNOT8-201ENST00000285896 NCAPD3P42695 1498 aa25.66■■□□□ 1.7
CNOT8-201ENST00000285896 HMGXB3Q12766 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
CNOT8-201ENST00000285896 TRIM41Q8WV44 630 aa25.62■■□□□ 1.69
CNOT8-201ENST00000285896 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.44■■□□□ 1.66
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC8Q09428 1581 aa25.36■■□□□ 1.65
CNOT8-201ENST00000285896 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.21■■□□□ 1.63
CNOT8-201ENST00000285896 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
CNOT8-201ENST00000285896 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CNOT8-201ENST00000285896 CFTRP13569 1480 aa25.15■■□□□ 1.62
CNOT8-201ENST00000285896 HRCP23327 699 aa25.08■■□□□ 1.6
CNOT8-201ENST00000285896 SYNJ1O43426 1573 aa25.05■■□□□ 1.6
CNOT8-201ENST00000285896 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.05■■□□□ 1.6
CNOT8-201ENST00000285896 SOGA1O94964 1423 aa24.95■■□□□ 1.59
CNOT8-201ENST00000285896 PRDM2Q13029 1718 aa24.94■■□□□ 1.58
CNOT8-201ENST00000285896 TOP2BQ02880 1626 aa24.92■■□□□ 1.58
CNOT8-201ENST00000285896 EEA1Q15075 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
CNOT8-201ENST00000285896 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.87■■□□□ 1.57
CNOT8-201ENST00000285896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
CNOT8-201ENST00000285896 CUX1P39880 1505 aa24.84■■□□□ 1.57
CNOT8-201ENST00000285896 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.83■■□□□ 1.57
CNOT8-201ENST00000285896 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.83■■□□□ 1.57
CNOT8-201ENST00000285896 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.78■■□□□ 1.56
CNOT8-201ENST00000285896 NESP48681 1621 aa24.77■■□□□ 1.56
CNOT8-201ENST00000285896 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.77■■□□□ 1.56
CNOT8-201ENST00000285896 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.73■■□□□ 1.55
CNOT8-201ENST00000285896 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
CNOT8-201ENST00000285896 GOLGA3Q08378 1498 aa24.58■■□□□ 1.53
CNOT8-201ENST00000285896 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.58■■□□□ 1.53
CNOT8-201ENST00000285896 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.55■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.55■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 KIF21BO75037 1637 aa24.54■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.54■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 KIF27Q86VH2 1401 aa24.54■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CNOT8-201ENST00000285896 TOPBP1Q92547 1522 aa24.51■■□□□ 1.51
CNOT8-201ENST00000285896 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 CUX2O14529 1486 aa24.44■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 CEP162Q5TB80 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.43■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.41■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 PRXQ9BXM0 1461 aa24.41■■□□□ 1.5
CNOT8-201ENST00000285896 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.36■■□□□ 1.49
CNOT8-201ENST00000285896 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.35■■□□□ 1.49
CNOT8-201ENST00000285896 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.33■■□□□ 1.48
CNOT8-201ENST00000285896 IGF1RP08069 1367 aa24.32■■□□□ 1.48
CNOT8-201ENST00000285896 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.25■■□□□ 1.47
CNOT8-201ENST00000285896 CLIP1P30622 1438 aa24.21■■□□□ 1.47
CNOT8-201ENST00000285896 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.19■■□□□ 1.46
CNOT8-201ENST00000285896 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CNOT8-201ENST00000285896 WDR97A6NE52 1622 aa24.17■■□□□ 1.46
CNOT8-201ENST00000285896 ERCC6Q03468 1493 aa24.13■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 WDR62O43379 1518 aa24.09■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.08■■□□□ 1.45
CNOT8-201ENST00000285896 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.07■■□□□ 1.44
CNOT8-201ENST00000285896 CUL7Q14999 1698 aa24.05■■□□□ 1.44
CNOT8-201ENST00000285896 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CNOT8-201ENST00000285896 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.01■■□□□ 1.43
CNOT8-201ENST00000285896 IFT140Q96RY7 1462 aa23.98■■□□□ 1.43
CNOT8-201ENST00000285896 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CNOT8-201ENST00000285896 ARAP1Q96P48 1450 aa23.94■■□□□ 1.42
CNOT8-201ENST00000285896 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.424e-10■■■■■ 49.3
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.9■■□□□ 1.42
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CNOT8-201ENST00000285896 PBRM1Q86U86 1689 aa23.86■■□□□ 1.41
CNOT8-201ENST00000285896 GRIN2BQ13224 1484 aa23.85■■□□□ 1.41
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