Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 316.86■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 37.3
ILF3Q12906 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 37.3
ILF3Q12906 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 37.3
ILF3Q12906 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 213.43□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 37.3
ILF3Q12906 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-11■■■■■ 37.2
ILF3Q12906 IQGAP3-203ENST00000491900 5294 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.54e-11■■■■■ 37.2
ILF3Q12906 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-11■■■■■ 37.2
ILF3Q12906 C3-217ENST00000602053 621 ntTSL 27.69□□□□□ -1.184e-11■■■■■ 37.2
ILF3Q12906 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 37
ILF3Q12906 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 416.6■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 TGFBR3-203ENST00000417833 551 ntTSL 413.09□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 37
ILF3Q12906 TGFBR3-211ENST00000533370 563 ntTSL 411.92□□□□□ -0.52e-9■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-206ENST00000549939 653 ntTSL 513.05□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-201ENST00000302533 890 ntTSL 311.15□□□□□ -0.624e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-207ENST00000557259 775 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.824e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.154e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 37
ILF3Q12906 AC087633.2-204ENST00000621842 496 ntTSL 59.81□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 36.7
ILF3Q12906 AC087633.2-205ENST00000615751 500 ntTSL 56.22□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 36.7
ILF3Q12906 NARS2-207ENST00000529880 755 ntTSL 312.08□□□□□ -0.489e-9■■■■■ 36.5
ILF3Q12906 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 322.01■■□□□ 1.119e-18■■■■■ 36.4
ILF3Q12906 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 36.4
ILF3Q12906 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.03□□□□□ -1.764e-9■■■■■ 36.4
ILF3Q12906 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 36.3
ILF3Q12906 AP000295.1-202ENST00000432231 753 ntTSL 26.06□□□□□ -1.442e-11■■■■■ 36.3
ILF3Q12906 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.442e-11■■■■■ 36.3
ILF3Q12906 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-19■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-206ENST00000548934 640 ntTSL 35.4□□□□□ -1.547e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-211ENST00000552515 367 ntTSL 34.46□□□□□ -1.77e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.727e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-203ENST00000544007 1003 ntTSL 24.07□□□□□ -1.767e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 G2E3-205ENST00000547638 566 ntTSL 44.02□□□□□ -1.777e-8■■■■■ 36.2
ILF3Q12906 ST3GAL6-206ENST00000466482 540 ntTSL 422.25■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-203ENST00000460774 582 ntTSL 319.33■□□□□ 0.681e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-226ENST00000497008 564 ntTSL 419.29■□□□□ 0.681e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-204ENST00000462152 1102 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-227ENST00000497621 2109 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-213ENST00000480133 360 ntTSL 417.92■□□□□ 0.461e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-219ENST00000489112 804 ntTSL 317.43■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-208ENST00000469105 2837 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-217ENST00000486249 3148 ntTSL 211.24□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-205ENST00000465004 314 ntTSL 23.97□□□□□ -1.771e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 ST3GAL6-218ENST00000486334 750 ntTSL 53.6□□□□□ -1.831e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 518.64■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-224ENST00000561991 964 ntTSL 517.48■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 515.56■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-220ENST00000487932 6464 ntTSL 515.27■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 513.43□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 513.37□□□□□ -0.274e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 512.26□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-216ENST00000483731 4193 ntTSL 512.15□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 36.1
ILF3Q12906 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 36
ILF3Q12906 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 36
ILF3Q12906 EGLN1-202ENST00000476717 829 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.523e-8■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-214ENST00000474009 561 ntTSL 317.21■□□□□ 0.355e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.055e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 515.19■□□□□ 0.025e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 212.32□□□□□ -0.445e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 WNK2-216ENST00000479696 532 ntTSL 37.87□□□□□ -1.155e-9■■■■■ 36
ILF3Q12906 QPCTL-203ENST00000591606 561 ntTSL 321.01■□□□□ 0.954e-11■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-11■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-11■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-205ENST00000475483 734 ntTSL 313.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-204ENST00000466678 1708 ntTSL 313.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 27□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 ATP1B3-210ENST00000495216 418 ntTSL 32.31□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 35.9
ILF3Q12906 CDC42SE2-207ENST00000504701 567 ntTSL 422.54■■□□□ 1.29e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-209ENST00000506419 458 ntTSL 314.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.469e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-211ENST00000511432 286 ntTSL 53.13□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 CDC42SE2-205ENST00000502840 539 ntTSL 42.77□□□□□ -1.979e-7■■■■■ 35.7
ILF3Q12906 AKAP8-203ENST00000595416 557 ntTSL 320.67■□□□□ 0.91e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 AKAP8-205ENST00000599883 860 ntTSL 519.22■□□□□ 0.671e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 AKAP8-202ENST00000537303 1350 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 35.6
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