Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 FIT3YOR383C 615 nt8.38□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 BSP1YPR171W 1731 nt8.37□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 ACH1YBL015W 1581 nt8.37□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 OYE3YPL171C 1203 nt8.37□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 KES1YPL145C 1305 nt8.36□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 UGP1YKL035W 1500 nt8.36□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 PET8YNL003C 855 nt8.36□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 LSB6YJL100W 1824 nt8.36□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 CLB6YGR109C 1143 nt8.35□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 GND2YGR256W 1479 nt8.34□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 ZAP1YJL056C 2643 nt8.33□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 FMS1YMR020W 1527 nt8.33□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 ILV2YMR108W 2064 nt8.33□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 SGA1YIL099W 1650 nt8.32□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 SAM2YDR502C 1155 nt8.31□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 SPP2YOR148C 558 nt8.31□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 FLR1YBR008C 1647 nt8.3□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 NME1NME1 340 nt8.3□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 YMR103CYMR103C 363 nt8.29□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 MEP3YPR138C 1470 nt8.28□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 RBG2YGR173W 1107 nt8.28□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 VPS62YGR141W 1404 nt8.28□□□□□ -1.08
SSK1Q07084 YPS3YLR121C 1527 nt8.27□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 RSC8YFR037C 1674 nt8.27□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 GTB1YDR221W 2109 nt8.26□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 QDR2YIL121W 1629 nt8.26□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 PSD1YNL169C 1503 nt8.26□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 OXA1YER154W 1209 nt8.26□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 YLR279WYLR279W 390 nt8.26□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 URA8YJR103W 1737 nt8.24□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 DTR1YBR180W 1719 nt8.23□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 YDL086WYDL086W 822 nt8.23□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 HEM13YDR044W 987 nt8.23□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 CYT1YOR065W 930 nt8.23□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 DLD2YDL178W 1593 nt8.22□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 CAB5YDR196C 726 nt8.22□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 TSC10YBR265W 963 nt8.22□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 MSB4YOL112W 1479 nt8.21□□□□□ -1.09
SSK1Q07084 SEC61YLR378C 1443 nt8.2□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 FCY21YER060W 1587 nt8.2□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 YMR226CYMR226C 804 nt8.2□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 DIG1YPL049C 1359 nt8.2□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 YHL008CYHL008C 1884 nt8.19□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 DMA2YNL116W 1569 nt8.18□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 GID8YMR135C 1368 nt8.18□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 PHO23YNL097C 993 nt8.17□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 MSC1YML128C 1542 nt8.17□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 APT2YDR441C 546 nt8.16□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 YGR012WYGR012W 1182 nt8.16□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 RAD23YEL037C 1197 nt8.15□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.15□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 SDH5YOL071W 489 nt8.15□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 ODC1YPL134C 933 nt8.15□□□□□ -1.1
SSK1Q07084 BNI5YNL166C 1347 nt8.14□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 FUB1YCR076C 753 nt8.14□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 YLR111WYLR111W 333 nt8.14□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 MRS6YOR370C 1812 nt8.13□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 YKL133CYKL133C 1392 nt8.12□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 CSM1YCR086W 573 nt8.12□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 SSL2YIL143C 2532 nt8.11□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 YER188WYER188W 720 nt8.1□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 TOK1YJL093C 2076 nt8.1□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 RIB3YDR487C 627 nt8.09□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 TAT2YOL020W 1779 nt8.09□□□□□ -1.11
SSK1Q07084 YHR219WYHR219W 1875 nt8.09□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 SAM3YPL274W 1764 nt8.07□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 GAL2YLR081W 1725 nt8.06□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 HXK1YFR053C 1458 nt8.06□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 OSH7YHR001W 1314 nt8.05□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 AIM1YAL046C 357 nt8.05□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 YHR218WYHR218W 1812 nt8.03□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 THI72YOR192C 1800 nt8.03□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 ALD5YER073W 1563 nt8.03□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 PRY1YJL079C 900 nt8.03□□□□□ -1.12
SSK1Q07084 MDM35YKL053C-A 261 nt8.02□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 CWP2YKL096W-A 279 nt8.02□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 YLR046CYLR046C 813 nt8.02□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.02□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 TIM44YIL022W 1296 nt8.01□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 SMM1YNR015W 1155 nt8.01□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 YDR455CYDR455C 309 nt8□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 LSR1LSR1 1175 nt8□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 DLD3YEL071W 1491 nt8□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 HXT10YFL011W 1641 nt8□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 NUC1YJL208C 990 nt7.99□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 HEM14YER014W 1620 nt7.99□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 RAS2YNL098C 969 nt7.98□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 GND1YHR183W 1470 nt7.98□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 SOL2YCR073W-A 948 nt7.97□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 GPN2YOR262W 1044 nt7.97□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 EAF3YPR023C 1206 nt7.97□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 RPD3YNL330C 1302 nt7.97□□□□□ -1.13
SSK1Q07084 ENT4YLL038C 744 nt7.96□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.95□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.95□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.95□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.95□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 YRF1-2YER190W 5046 nt7.94□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ITR2YOL103W 1830 nt7.94□□□□□ -1.14
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