Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 LSM12YHR121W 564 nt9.6□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 SCO2YBR024W 906 nt9.59□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 ICE2YIL090W 1476 nt9.59□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YHP1YDR451C 1062 nt9.58□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 MET28YIR017C 564 nt9.57□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 AIM45YPR004C 1035 nt9.57□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 EEB1YPL095C 1371 nt9.57□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 GLR1YPL091W 1452 nt9.56□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 YJL211CYJL211C 444 nt9.56□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 YMR244WYMR244W 1068 nt9.55□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 YNL165WYNL165W 1221 nt9.55□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 ZRT3YKL175W 1512 nt9.55□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 DBP1YPL119C 1854 nt9.55□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 HXT1YHR094C 1713 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 RPL4BYDR012W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 YAR028WYAR028W 705 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 RPL4AYBR031W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 NRT1YOR071C 1797 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 CMP2YML057W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 UTH1YKR042W 1098 nt9.53□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 AIM41YOR215C 558 nt9.53□□□□□ -0.88
HDA3Q06623 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 NDI1YML120C 1542 nt9.51□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 RBG1YAL036C 1110 nt9.51□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 RMA1YKL132C 1293 nt9.51□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 BNA3YJL060W 1335 nt9.51□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 MPC1YGL080W 393 nt9.5□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 MTG2YHR168W 1557 nt9.5□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 INA1YLR413W 2028 nt9.49□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 RPS14BYJL191W 417 nt9.49□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 LIP1YMR298W 453 nt9.49□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YBL086CYBL086C 1401 nt9.48□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 RPC82YPR190C 1965 nt9.47□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 SED1YDR077W 1017 nt9.47□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 SHY1YGR112W 1170 nt9.47□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 YJL067WYJL067W 351 nt9.47□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 ZTA1YBR046C 1005 nt9.47□□□□□ -0.89
HDA3Q06623 AKR2YOR034C 2250 nt9.46□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.44□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 YNL234WYNL234W 1281 nt9.44□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 SPT20YOL148C 1815 nt9.44□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 HSL7YBR133C 2484 nt9.44□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 GET2YER083C 858 nt9.43□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 FIT3YOR383C 615 nt9.43□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 ALP1YNL270C 1722 nt9.42□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 VAR1Q0140 1197 nt9.41□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 RBG2YGR173W 1107 nt9.4□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 PZF1YPR186C 1290 nt9.4□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 MRPL36YBR122C 534 nt9.4□□□□□ -0.9
HDA3Q06623 SIR2YDL042C 1689 nt9.39□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 SAM1YLR180W 1149 nt9.38□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 YPL251WYPL251W 303 nt9.38□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 LEU9YOR108W 1815 nt9.38□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 YMR226CYMR226C 804 nt9.37□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 BRR1YPR057W 1026 nt9.37□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 MRS3YJL133W 945 nt9.36□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 TOA2YKL058W 369 nt9.36□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 UFO1YML088W 2007 nt9.35□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.34□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 URA6YKL024C 615 nt9.34□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 YML079WYML079W 606 nt9.34□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 TSC10YBR265W 963 nt9.34□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 MAS1YLR163C 1389 nt9.34□□□□□ -0.91
HDA3Q06623 PCL10YGL134W 1302 nt9.33□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 YLR279WYLR279W 390 nt9.33□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 MMS21YEL019C 804 nt9.32□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 TAF4YMR005W 1167 nt9.32□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 SDH5YOL071W 489 nt9.32□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 GND2YGR256W 1479 nt9.32□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 YLR036CYLR036C 612 nt9.31□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 ATG22YCL038C 1587 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 YGR012WYGR012W 1182 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 YMR103CYMR103C 363 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 GAT1YFL021W 1533 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 IDP3YNL009W 1263 nt9.29□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 OCA1YNL099C 717 nt9.29□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 OYE3YPL171C 1203 nt9.29□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 MSB4YOL112W 1479 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 MEP3YPR138C 1470 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 RRP1YDR087C 837 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA3Q06623 SUA5YGL169W 1281 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 YLR111WYLR111W 333 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 COA2YPL189C-A 207 nt9.26□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 CWC15YDR163W 528 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 SED5YLR026C 1023 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 PET8YNL003C 855 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 YPR150WYPR150W 522 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 ALG7YBR243C 1347 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 UGA4YDL210W 1716 nt9.25□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 CWC25YNL245C 540 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 YOR325WYOR325W 474 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 NDJ1YOL104C 1059 nt9.23□□□□□ -0.93
HDA3Q06623 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.22□□□□□ -0.93
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