Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 SAM2YDR502C 1155 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 CLB6YGR109C 1143 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 PAU16YKL224C 372 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 YPS3YLR121C 1527 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 BSP1YPR171W 1731 nt8.88□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 MEP3YPR138C 1470 nt8.88□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 RPL4BYDR012W 1089 nt8.87□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 RPL4AYBR031W 1089 nt8.87□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 XYL2YLR070C 1071 nt8.86□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 YMR103CYMR103C 363 nt8.86□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 FLR1YBR008C 1647 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 OXA1YER154W 1209 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 ODC1YPL134C 933 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 SEC61YLR378C 1443 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR226CQ05016 SBA1YKL117W 651 nt8.83□□□□□ -1
YMR226CQ05016 GID8YMR135C 1368 nt8.83□□□□□ -1
YMR226CQ05016 MSF1YPR047W 1410 nt8.82□□□□□ -1
YMR226CQ05016 RPS14BYJL191W 417 nt8.82□□□□□ -1
YMR226CQ05016 AIM45YPR004C 1035 nt8.82□□□□□ -1
YMR226CQ05016 SFP1YLR403W 2052 nt8.82□□□□□ -1
YMR226CQ05016 DLD2YDL178W 1593 nt8.82□□□□□ -1
YMR226CQ05016 YHR218WYHR218W 1812 nt8.81□□□□□ -1
YMR226CQ05016 SSL2YIL143C 2532 nt8.81□□□□□ -1
YMR226CQ05016 YGL034CYGL034C 366 nt8.8□□□□□ -1
YMR226CQ05016 NAT4YMR069W 858 nt8.8□□□□□ -1
YMR226CQ05016 UGA4YDL210W 1716 nt8.78□□□□□ -1
YMR226CQ05016 YKL133CYKL133C 1392 nt8.77□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 UBX6YJL048C 1191 nt8.77□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 MRS6YOR370C 1812 nt8.77□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 MDM35YKL053C-A 261 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 CWP2YKL096W-A 279 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 GID7YCL039W 2238 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 TPO4YOR273C 1980 nt8.74□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 HMG2YLR450W 3138 nt8.73□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 HEM13YDR044W 987 nt8.73□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 YER188WYER188W 720 nt8.72□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 YHR219WYHR219W 1875 nt8.71□□□□□ -1.01
YMR226CQ05016 PHO23YNL097C 993 nt8.69□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 HXK1YFR053C 1458 nt8.69□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 MSC1YML128C 1542 nt8.69□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 APT2YDR441C 546 nt8.68□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 TSC10YBR265W 963 nt8.68□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 BNI5YNL166C 1347 nt8.68□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 HXT10YFL011W 1641 nt8.67□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 OSH7YHR001W 1314 nt8.67□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 ENT4YLL038C 744 nt8.67□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 YLR279WYLR279W 390 nt8.67□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 ALD5YER073W 1563 nt8.66□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 RPD3YNL330C 1302 nt8.66□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 FUB1YCR076C 753 nt8.66□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 DLD3YEL071W 1491 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 PCP1YGR101W 1041 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 TIM44YIL022W 1296 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 RBG1YAL036C 1110 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 AIM1YAL046C 357 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 YLR046CYLR046C 813 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 LSR1LSR1 1175 nt8.65□□□□□ -1.02
YMR226CQ05016 MSB4YOL112W 1479 nt8.62□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 YMR262WYMR262W 942 nt8.61□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 FCY21YER060W 1587 nt8.61□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 YGR012WYGR012W 1182 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 YOR072WYOR072W 315 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 AGP3YFL055W 1677 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR226CQ05016 KRR1YCL059C 951 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 GPN2YOR262W 1044 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 NUC1YJL208C 990 nt8.57□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 NBA1YOL070C 1506 nt8.57□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 TAT2YOL020W 1779 nt8.56□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 RAS2YNL098C 969 nt8.56□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 VMA11YPL234C 495 nt8.56□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 SOL2YCR073W-A 948 nt8.55□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 SDH5YOL071W 489 nt8.55□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 NPP1YCR026C 2229 nt8.54□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 CSM1YCR086W 573 nt8.53□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 RPC31YNL151C 756 nt8.53□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 RIM2YBR192W 1134 nt8.53□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 ITR2YOL103W 1830 nt8.52□□□□□ -1.04
YMR226CQ05016 INH1YDL181W 258 nt8.51□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 TIP1YBR067C 633 nt8.51□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 ESBP6YNL125C 2022 nt8.5□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 SNX3YOR357C 489 nt8.48□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.48□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 LSB5YCL034W 1065 nt8.48□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 PRY1YJL079C 900 nt8.47□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 URA8YJR103W 1737 nt8.46□□□□□ -1.05
YMR226CQ05016 RAD23YEL037C 1197 nt8.46□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 EAF3YPR023C 1206 nt8.46□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 DPL1YDR294C 1770 nt8.45□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 YDR455CYDR455C 309 nt8.45□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 OYE2YHR179W 1203 nt8.45□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 RPT5YOR117W 1305 nt8.44□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 YIL177CYIL177C 5277 nt8.43□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 SAM3YPL274W 1764 nt8.43□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 MEX67YPL169C 1800 nt8.43□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 SMM1YNR015W 1155 nt8.43□□□□□ -1.06
YMR226CQ05016 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms