Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFV3P56181 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFV3P56181 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFV3P56181 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFV3P56181 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFV3P56181 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFV3P56181 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFV3P56181 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFV3P56181 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFV3P56181 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms