Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP153P49790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP153P49790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP153P49790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP153P49790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP153P49790 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NUP153P49790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NUP153P49790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NUP153P49790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NUP153P49790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
NUP153P49790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NUP153P49790 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
NUP153P49790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NUP153P49790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
NUP153P49790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
NUP153P49790 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NUP153P49790 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NUP153P49790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NUP153P49790 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
NUP153P49790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
NUP153P49790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
NUP153P49790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NUP153P49790 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NUP153P49790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
NUP153P49790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NUP153P49790 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NUP153P49790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NUP153P49790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NUP153P49790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NUP153P49790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NUP153P49790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NUP153P49790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
NUP153P49790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NUP153P49790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NUP153P49790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NUP153P49790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NUP153P49790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NUP153P49790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
NUP153P49790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
NUP153P49790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NUP153P49790 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
NUP153P49790 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
NUP153P49790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NUP153P49790 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NUP153P49790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NUP153P49790 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NUP153P49790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NUP153P49790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NUP153P49790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NUP153P49790 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NUP153P49790 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NUP153P49790 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NUP153P49790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
NUP153P49790 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NUP153P49790 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NUP153P49790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NUP153P49790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NUP153P49790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NUP153P49790 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NUP153P49790 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NUP153P49790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NUP153P49790 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NUP153P49790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NUP153P49790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NUP153P49790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NUP153P49790 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NUP153P49790 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
NUP153P49790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
NUP153P49790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NUP153P49790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NUP153P49790 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NUP153P49790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NUP153P49790 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NUP153P49790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NUP153P49790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NUP153P49790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
NUP153P49790 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NUP153P49790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NUP153P49790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NUP153P49790 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NUP153P49790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NUP153P49790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NUP153P49790 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NUP153P49790 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP153P49790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NUP153P49790 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
NUP153P49790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NUP153P49790 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NUP153P49790 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP153P49790 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP153P49790 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NUP153P49790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NUP153P49790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NUP153P49790 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
NUP153P49790 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms