Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 RPL4BYDR012W 1089 nt7.73□□□□□ -1.17
AVT5P38176 YAR028WYAR028W 705 nt7.73□□□□□ -1.17
AVT5P38176 RPL4AYBR031W 1089 nt7.73□□□□□ -1.17
AVT5P38176 TPN1YGL186C 1740 nt7.72□□□□□ -1.17
AVT5P38176 YGL034CYGL034C 366 nt7.72□□□□□ -1.17
AVT5P38176 UTH1YKR042W 1098 nt7.72□□□□□ -1.17
AVT5P38176 XYL2YLR070C 1071 nt7.72□□□□□ -1.17
AVT5P38176 PHO23YNL097C 993 nt7.71□□□□□ -1.18
AVT5P38176 AIM45YPR004C 1035 nt7.71□□□□□ -1.18
AVT5P38176 GID8YMR135C 1368 nt7.71□□□□□ -1.18
AVT5P38176 MDM35YKL053C-A 261 nt7.7□□□□□ -1.18
AVT5P38176 SBA1YKL117W 651 nt7.7□□□□□ -1.18
AVT5P38176 FIT3YOR383C 615 nt7.7□□□□□ -1.18
AVT5P38176 NBA1YOL070C 1506 nt7.69□□□□□ -1.18
AVT5P38176 SSL2YIL143C 2532 nt7.69□□□□□ -1.18
AVT5P38176 SED1YDR077W 1017 nt7.69□□□□□ -1.18
AVT5P38176 DAK2YFL053W 1776 nt7.69□□□□□ -1.18
AVT5P38176 LPD1YFL018C 1500 nt7.68□□□□□ -1.18
AVT5P38176 LIP1YMR298W 453 nt7.68□□□□□ -1.18
AVT5P38176 RFC1YOR217W 2586 nt7.67□□□□□ -1.18
AVT5P38176 ALP1YNL270C 1722 nt7.66□□□□□ -1.18
AVT5P38176 MRS6YOR370C 1812 nt7.66□□□□□ -1.18
AVT5P38176 YKL133CYKL133C 1392 nt7.66□□□□□ -1.18
AVT5P38176 MTG2YHR168W 1557 nt7.66□□□□□ -1.18
AVT5P38176 RPS14BYJL191W 417 nt7.65□□□□□ -1.18
AVT5P38176 MIM1YOL026C 342 nt7.65□□□□□ -1.18
AVT5P38176 ZTA1YBR046C 1005 nt7.65□□□□□ -1.18
AVT5P38176 FIT1YDR534C 1587 nt7.63□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YBL086CYBL086C 1401 nt7.63□□□□□ -1.19
AVT5P38176 TOM71YHR117W 1920 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 URA6YKL024C 615 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
AVT5P38176 DIG1YPL049C 1359 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 LSR1LSR1 1175 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 LEU9YOR108W 1815 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 AKR2YOR034C 2250 nt7.61□□□□□ -1.19
AVT5P38176 AGP3YFL055W 1677 nt7.6□□□□□ -1.19
AVT5P38176 SAM1YLR180W 1149 nt7.6□□□□□ -1.19
AVT5P38176 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.57□□□□□ -1.2
AVT5P38176 TSC10YBR265W 963 nt7.57□□□□□ -1.2
AVT5P38176 BRR1YPR057W 1026 nt7.56□□□□□ -1.2
AVT5P38176 TOA2YKL058W 369 nt7.55□□□□□ -1.2
AVT5P38176 SPP2YOR148C 558 nt7.55□□□□□ -1.2
AVT5P38176 UFO1YML088W 2007 nt7.55□□□□□ -1.2
AVT5P38176 VPS62YGR141W 1404 nt7.54□□□□□ -1.2
AVT5P38176 TIM44YIL022W 1296 nt7.54□□□□□ -1.2
AVT5P38176 PET8YNL003C 855 nt7.54□□□□□ -1.2
AVT5P38176 YPL251WYPL251W 303 nt7.53□□□□□ -1.2
AVT5P38176 BSP1YPR171W 1731 nt7.52□□□□□ -1.2
AVT5P38176 ACH1YBL015W 1581 nt7.52□□□□□ -1.21
AVT5P38176 OYE3YPL171C 1203 nt7.52□□□□□ -1.21
AVT5P38176 HBS1YKR084C 1836 nt7.52□□□□□ -1.21
AVT5P38176 YDL086WYDL086W 822 nt7.51□□□□□ -1.21
AVT5P38176 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.51□□□□□ -1.21
AVT5P38176 YHR219WYHR219W 1875 nt7.51□□□□□ -1.21
AVT5P38176 CWP2YKL096W-A 279 nt7.5□□□□□ -1.21
AVT5P38176 SDH5YOL071W 489 nt7.5□□□□□ -1.21
AVT5P38176 MET30YIL046W 1923 nt7.5□□□□□ -1.21
AVT5P38176 GND2YGR256W 1479 nt7.49□□□□□ -1.21
AVT5P38176 DUS3YLR401C 2007 nt7.49□□□□□ -1.21
AVT5P38176 LSM5YER146W 282 nt7.49□□□□□ -1.21
AVT5P38176 YLR279WYLR279W 390 nt7.49□□□□□ -1.21
AVT5P38176 ALR1YOL130W 2580 nt7.49□□□□□ -1.21
AVT5P38176 YGR012WYGR012W 1182 nt7.48□□□□□ -1.21
AVT5P38176 FMS1YMR020W 1527 nt7.47□□□□□ -1.21
AVT5P38176 YMR103CYMR103C 363 nt7.47□□□□□ -1.21
AVT5P38176 RPD3YNL330C 1302 nt7.47□□□□□ -1.21
AVT5P38176 APT2YDR441C 546 nt7.46□□□□□ -1.22
AVT5P38176 SAM2YDR502C 1155 nt7.46□□□□□ -1.22
AVT5P38176 DUR3YHL016C 2208 nt7.46□□□□□ -1.22
AVT5P38176 SFL1YOR140W 2301 nt7.45□□□□□ -1.22
AVT5P38176 POP2YNR052C 1302 nt7.45□□□□□ -1.22
AVT5P38176 YNL190WYNL190W 615 nt7.44□□□□□ -1.22
AVT5P38176 SEC61YLR378C 1443 nt7.44□□□□□ -1.22
AVT5P38176 MSB4YOL112W 1479 nt7.43□□□□□ -1.22
AVT5P38176 RAD23YEL037C 1197 nt7.43□□□□□ -1.22
AVT5P38176 OXA1YER154W 1209 nt7.43□□□□□ -1.22
AVT5P38176 YMR262WYMR262W 942 nt7.43□□□□□ -1.22
AVT5P38176 FET5YFL041W 1869 nt7.43□□□□□ -1.22
AVT5P38176 snR4snR4 186 nt7.42□□□□□ -1.22
AVT5P38176 FRA1YLL029W 2250 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms