Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAL4O96015 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAL4O96015 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
DNAL4O96015 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms