Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN7O15265 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN7O15265 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN7O15265 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN7O15265 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN7O15265 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN7O15265 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN7O15265 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms