Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TNIKQ9UKE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNIKQ9UKE5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms