Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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